В альтернативном средневековье, где люди вынуждены сосуществовать с ужасными оборотнями — ёма, мир погружается в страх и хаос. Эти существа способны принимать облик своих жертв, скрываясь среди людей и питаясь их мясом. Узнав о тайнах прошлой жизни человека, чьи мозги они поглотили, ёма становятся ещё опаснее, без труда проникая в человеческие поселения. Для борьбы с этой угрозой создан орден клеймор — могущественных воинов, полулюдей-полумонстров, способных противостоять ёма.
Каждый клеймор обладает уникальными способностями благодаря крови и плоти ёма, введённым в их организм. Этим воинам под силу не только сражаться с ёма на равных, но и чаще всего превосходить их в силе и смекалке. Несмотря на свои необычные возможности, клеймор сохраняют человеческие эмоции и разум, что позволяет им различать добро и зло. Однако союз крови с ёма оставляет на них свой отпечаток, превращая их в изгнанников и вызывая опасения среди простого народа.
Сюжет начинает разворачиваться вокруг молодой воительницы по имени Клэр, которая выбрала путь клеймор, чтобы отомстить за гибель своих близких. В процессе своих приключений она сталкивается с множеством испытаний и противоречий, которые бросают вызов её человечности. Вместе с другими единомышленниками, Клэр путешествует по опасным землям, освобождая деревни от ёма и раскрывая заговоры, плетущиеся тёмными силами в тайнах Организации, создавшей их.
Каждая битва приближает Клэр к раскрытию своей истинной силы и постижению своего предназначения. Её история — это не только борьба с ёма, но и путешествие к собственному осознанию и принятию себя. В ходе многочисленных сражений и внутренних конфликтов, она узнаёт, что между коллегами по ордену и Организацией существуют скрытые секреты и подозрения. Это открытие заставляет её переосмыслить своё место в мире и принимать решения, которые определят не только судьбу клеймор, но и всех людей, живущих в страхе перед ёма.
