Цукунэ Аоно, сам того не осознавая, оказывается в центре сложной и опасной игры, когда поступает в Призрачную Академию, учреждение для сверхъестественных существ, замаскированных под обычных людей. Каждый день приносит ему новые открытия и испытания. Вскоре он узнает, что большинство студентов здесь — это ёкаи, существа из фольклора, обладающие невероятными способностями и живущие по собственным законам. Однако, благодаря дружбе с обаятельной и загадочной вампиршей Мокой и своей природной доброте, Цукунэ удается установить связь с этой таинственной версией школы.
Пока Цукунэ адаптируется к новой школьной жизни, он сталкивается с самыми разнообразными существами. Его одноклассники, такие как энергичная Сукубус Курому, стремящаяся завоевать внимание парня, и тихая, но сильная ведьма Юкари, становятся его союзниками в этом странном мире. Вместе они сталкиваются с различными учебными испытаниями, где требуется не только академические знания, но и ловкость, смекалка и способность защитить себя и своих друзей от угроз.
Однако жизнь в Призрачной Академии также имеет свои темные стороны. Вскоре Цукунэ начинает понимать, что школа полна тайн и опасностей, которые могут угрожать не только ему, но и всей Академии. На фоне романтических приключений с Мокой, череда опасных событий, словно по мановению волшебной руки, начинает сплетаться вокруг него. Пребывание в школе становится испытанием на выживание, когда старые враги Моки начинают искать возможность отомстить ей и тем, кто ей дорог. А загадочный барьер, защищающий школу от внешних угроз, начинает проявлять сбои, порождая слухи о заговоре внутри стен Академии.
Пытаясь выжить в этом смертоносном мире и не выдать свою истинную природу обычного человека, Цукунэ учится искусству обмана и манипуляций, а также пытается разобраться в своих чувствах к Моке, ведь каждая встреча с её истинной сущностью обнажает в ней нечто большее, чем просто вампирские инстинкты. Это история о том, как юноша без сверхспособностей, но с огромным сердцем, может стать героем и другом для тех, кто никогда не думал, что способен на дружбу с человеком.
