Сериал начинается с того, как главную героиню, Никиту, несправедливо обвиняют в убийстве, которого она не совершала. Она оказывается в безжалостной тюрьме, и обречена на смерть. Однако, вместо того чтобы быть казненной, она попадает в тайную правительственную организацию, известную как "Отдел". Эта организация видит в ней огромный потенциал и предлагает ей сделку: стать тайным агентом-убийцей в обмен на свою жизнь. Без иной надежды на спасение, Никита соглашается.
Попав в "Отдел", Никите приходится столкнуться с жестокой реальностью: здесь нет места слабости, а доверие становится роскошью. Её обучают различным видам боевых искусств и мастерству владения оружием. Постепенно она становится одной из лучших в своем деле, но роковой взнос за это — её свобода. Теперь Никита вынуждена выполнять смертельно опасные задания, убирая тех, кого считает угрозой государству, и подчиняться приказам без права на отказ.
Но Никита не теряет надежды. Она начинает вести двойную игру, стараясь выжить в мире, где каждый может предать, и одновременно планируя своё побег. Её главным союзником становится Майкл — агент, который, видимо, единственный видит в ней человека, а не просто машину для убийств. Между ними зарождаются сложные отношения, наполненные напряжением и скрываемыми чувствами.
В ходе выполнения миссий Никита сталкивается с различными моральными дилеммами: стоит ли убивать невинных ради "высших целей"? Она начинает осознавать, что "Отдел" не всегда действует во благо. Все больше и больше её действий начинают пробуждать в ней прежнюю личность, и Никита начинает задаваться вопросом, сможет ли она когда-нибудь освободиться полностью.
События разворачиваются стремительно: ее ждут коварные враги, интриги внутри "Отдела", и Никите предстоит принять нелегкие решения, которые навсегда изменят её жизнь и жизни тех, кто оказался вовлечен в эту игру. С каждым новым эпизодом она приближается к истине и раскрытию тайн, скрытых за стенами "Отдела", осознавая, что путь к свободе может оказаться длиннее, чем она ожидала.
