Черепашки-ниндзя — Леонардо, Рафаэль, Микеланджело и Донателло — под руководством своего мудрого сенсея Сплинтера долгое время скрывались в тенях, тренируясь в искусстве ниндзя. Их укромный дом — канализация Нью-Йорка, безопасное убежище, где они могли развивать свои навыки и изучать мир, который всегда оставался для них недоступным. Однако, когда опасность, исходящая от Шреддера и его Клана Футов, достигает пика, черепашки понимают, что пришло время выйти на свет и защитить свой город.
Шреддер, таинственный и мощный лидер Клана, строит планы по захвату власти, используя свою армию безжалостных и обученных воинов. Его методы жестоки, а цель — полный контроль над городом, но его истинные намерения остаются загадкой. Черепашки-ниндзя, каждая из которых обладает уникальными способностями и характером, вынуждены работать как единое целое. Леонардо, как лидер, направляет команду, Рафаэль привносит силу и решимость, Донателло — интеллект и изобретательность, а Микеланджело — неподдельное веселье и оптимизм.
На помощь черепашкам приходит Эйприл О'Нил, энергичная и целеустремлённая журналистка, чья храбрость и решимость находят в черепашках верных союзников. Вместе они пытаются раскрыть планы Шреддера и остановить его до того, как он превратит Нью-Йорк в заложника своих дьявольских замыслов. На пути их ждут множество испытаний, невероятные сражения и неожиданные открытия.
Вместе с оператором Верном Фенвиком, который поначалу скептически относится к идее сотрудничества с мутантами-черепахами, Эйприл и черепашки погружаются в мир интриг и опасностей. Им предстоит освоить искусство командной работы и доверия, ведь только вместе они смогут противостоять надвигающейся угрозе. В борьбе за свободу Нью-Йорка они открывают, что настоящая сила заключена не только в мастерстве боевых искусств, но и в дружбе, верности и стойкости перед лицом опасности.
