Питер Паркер, теперь обладая невероятными способностями, такими как сверхчеловеческая ловкость, сила и умение карабкаться по стенам, начинает свою новую жизнь под маской Человека-Паука. Вскоре он придумывает себе костюм и самодельные паутины, чтобы беспрепятственно передвигаться по городским улицам Нью-Йорка. Однако не все так просто: балансировать между школьной жизнью, заботой о тёте Мэй и борьбой с преступниками оказывается непростой задачей.
Первым серьёзным испытанием для Питера становится столкновение с Зелёным Гоблином, в реальной жизни известным как Норман Осборн, отец его лучшего друга Гарри. Осборн, будучи успешным бизнесменом, попадает под воздействие экспериментального газа, что пробуждает в нем безумие и жажду власти. Зелёный Гоблин угрожает городу, и Питер должен противостоять ему, одновременно стараясь сохранить свою личность в тайне от близких. Битва Человека-Паука и Гоблина приводит к драматической развязке, в которой Питер осознаёт истинную цену героя.
С течением времени Питер сталкивается с новыми вызовами. Ему приходится противостоять таким злодеям, как Доктор Осьминог — гениальный учёный с механическими щупальцами, Песочный человек — преступник, способный превращать своё тело в песок, и Веном — инопланетный симбионт, который усиливает агрессию своего носителя. Каждый новый противник ставит перед Питером не только испытание силы и ловкости, но и вопрос о том, где проходит черта между добром и злом.
На личном фронте Питер испытывает сложности в отношениях с Мэри Джейн Уотсон, девушкой, в которую он давно влюблён. Их отношения проходят через испытания разлукой, недопониманием и опасными ситуациями, когда жизнь Мэри Джейн неоднократно оказывается под угрозой. Важно то, что, несмотря на все трудности, Питер остаётся верным своей миссии защищать город и заботиться о своих близких, справляясь с теми вызовами, которые ставит перед ним судьба.