Сериал "Дневник будущего" начинается с того, что Амано Юкитэру, обыкновенный школьник, живущий в своем собственном мире, где его единственным другом является воображаемый бог пространства и времени по имени Деус. Юкитэру ведет подробный дневник в своем мобильном телефоне, записывая всё, что происходит вокруг. Однако однажды его жизнь кардинально меняется. Деус, неожиданно проявившийся как вполне реальный субъект, наделяет дневник Юки способностью предсказывать будущее. Каждая запись, которую Юкитэру делает, становится пророчеством на несколько минут вперед, что позволяет ему с легкостью избегать неприятностей и неожиданно изменить свою жизнь к лучшему.
Но Юки быстро понимает, что этот дар имеет свою тёмную сторону. Оказывается, он не единственный, кто получил такой дневник. В игре, организованной Деусом, участвуют еще одиннадцать человек, каждый из которых обладает своим уникальным дневником, предсказывающим будущее в различных формах: от событий, связанных с конкретными людьми, до обширных катастроф. Игра носит смертоносный характер: победить может только один, и наградой станет возможность занять место Деуса.
Вскоре Юки встречает Юно Гасай, свою одноклассницу, которая оказывается весьма необычной девушкой. Она также участница игры и, обладая "Любовным дневником", одержимо влюблена в Юки, что делает её крайне опасной союзницей. Вместе они вынуждены противостоять другим владельцам дневников, каждый из которых пытается манипулировать событиями, чтобы уничтожить конкурентов и приблизиться к заветной цели.
По мере развития сюжета Юкитэру сталкивается с моральными дилеммами и испытаниями, которые заставляют его пересмотреть свои взгляды на жизнь, доверие и дружбу. С каждым новым столкновением с противниками он всё больше погружается в замысловатую и драматичную игру, где на кону стоит не только его собственное выживание, но и будущее всего мира.