Сериал "Последний серафим" разворачивается в мире, где человечество столкнулось с непреодолимой катастрофой — вирус, уничтоживший всех людей старше 13 лет. В хаосе и страхе, когда общество оказалось уязвимым, на арену вышли вампиры, воспользовавшиеся ситуацией и взявшие контроль над выжившими детьми. Юитиро Хакуяма, главный герой, пережил этот ужас в одном из сиротских домов, где вампиры держали детей как скот для обеспечения своей жажды крови.
Юитиро и его лучший друг, Микаэла Хакуяма, вместе с другими детьми из сиротского дома, строят планы побега из этого кошмара. Однако, во время попытки бегства всё идет не по плану: их планы раскрываются, и большинство детей погибает. Микаэла жертвует собой, чтобы Юитиро смог сбежать, что оставляет неизгладимый след в сердце главного героя и питает его ненависть к вампирам.
Спустя несколько лет Юитиро присоединяется к Японской Имперской Демонической Армии, организации, целью которой является истребление вампиров. Он решает посвятить свою жизнь борьбе с кровососами, намереваясь отомстить за смерть друзей. Обучаясь использовать особенности демонического оружия, Юитиро проявляет огромные способности и отвагу, привлекая внимание своих командиров и соратников.
Вместе с новыми друзьями, такими как Синоа Хираги и Ёичи Саотомэ, Юитиро не только сражается с вампирами, но и открывает для себя неожиданные истины о мире, в котором живет. Его ждет множество смертельно опасных заданий и эпических битв, которые не только проверяют его мужество, но и заставляют задуматься о природе человечности. В процессе он также обнаруживает шокирующую правду: его друг Микаэла не погиб, но сам превратился в вампира, что ставит Юитиро перед дилеммой — сможет ли он сохранить дружбу или их судьбы обречены на противостояние?