В густонаселённой Третьей деревне, где люди стремятся восстановить утраченный мир, герои находят спокойствие и временное убежище. Здесь Аска, Синдзи и Рэй начинают своё путешествие самопознания и восстановления. Они присоединяются к остальным жителям, создающим новую реальность после катастрофических событий, связанных с «Евангелионами». В Третьей деревне царит атмосфера дружбы и взаимопомощи: люди трудятся на полях, ремонтируют дома и проводят время с семьями, пытаясь забыть о трагических потерях.
Аска, закалённая испытаниями, заботится о Синдзи, который постепенно возвращается к жизни после глубокой депрессии. Рэй, обретая новые эмоции и чувства, учится взаимодействовать с окружающим миром. Вскоре Синдзи начинает работать вместе с жителями деревни, открывая для себя простые радости и ценности повседневной жизни. Он находит поддержку в новых друзьях и старых товарищах, которые помогают ему вновь обрести цель и уверенность.
Тем временем, за пределами деревни, скрывается угроза, готовая нарушить хрупкий мир. Организация WILLE, несмотря на успешную операцию в Париже, продолжает вести борьбу против противников, стремящихся воплотить свои зловещие планы. Напряжение нарастает, и действия прошлого напоминают о себе. Несмотря на желание отойти от битв, Синдзи и его друзья понимают, что их роль ещё не завершена, и им предстоит сделать трудный выбор, от которого зависит будущее человечества.
В этом новом мире герои учатся принимать свои слабости и преодолевать страхи, понимая, что только вместе они способны противостоять любым испытаниям. Черпая силы друг в друге, Синдзи, Аска и Рэй готовятся к новой схватке, в которой им предстоит не только сражаться с внешними врагами, но и преодолеть внутренние преграды, чтобы защитить всё, что они так старательно восстанавливают.