Капитан Харлок, легендарный космический пират, известный своей непредсказуемостью и отвагой, становится последней надеждой человечества в борьбе против могущественной корпорации Гайя. Его корабль, Аркадия, окружен тайнами и обладает невероятными способностями, которые делают его практически неуязвимым. Вместе со своей немногочисленной, но преданной командой, Харлок бросает вызов тирании, рискуя всем ради освобождения Земли.
Аркадия проносится сквозь звездные системы, поднимая восстание и сея хаос в рядах врагов. Отличающийся от других, Харлок не преследует личные выгоды — его ведет стремление освободить человечество от гнета. Почему он это делает, остается загадкой, ведь, казалось бы, судьба Земли его больше не касается. По мере развития сюжета, зрители погружаются в историю его прошлого, узнавая о предательстве и потере, которые вынудили его стать тем, кем он является.
Каждая серия раскрывает новые детали борьбы Харлока и его союзников против Гайя, представляя яркие космические сражения и глубокие размышления о цене свободы. Одна из ключевых сюжетных линий связана с молодой девушкой по имени Мая, скрывающей тайну, способную изменить ход войны. Харлок становится ее наставником и защитником, помогая ей понять, что будущее планеты в ее руках.
Аркадия сталкивается с сокрушительными угрозами: от космических флотилий Гайя до загадочных космических аномалий, каждая из которых ставит под сомнение крепость духа команды. В то же время, внутри самой корпорации зреет раскол — не все согласны с методами правления, и среди врагов появляются те, кто готов поддержать пиратов.
На протяжении сериала зрители видят, как каждый участник команды Харлока обретает свою роль в величайшем сопротивлении. Харлок же предстает не просто как герой или злодей, но как сложная и многогранная личность, чья мотивация переплетена с болью утрат и надеждой на светлое будущее. Каждая серия приближает команду Аркадии к финальной битве, в которой решится судьба человеческой расы и будущее всей галактики.